故事描述一个叫屁祖隐的女人带着5岁的少年来到野原广志和美冴的家里，告诉他们自己是广志和美冴的5岁儿子新之助的亲生母亲。二人留宿的当晚，野原家遭到神秘忍者集团的袭击。新之助被绑架了。屁祖隐家是忍者的故乡，世代守护着地球的…

　　繁华时尚的忍者岛，乐高小人们过着快乐无忧的日子，除了……隔三差五会遭到邪恶魔头加满都（贾斯汀·塞洛克斯 Justin Theroux 配音）的入侵骚扰外。当然，幸亏有英勇无畏的幻影忍者，他们一次次挺身而出，与魔王大战，才使得忍者岛免…

　　当他们的世界忍者的命运受到巨大威胁的挑战时，就由忍者来拯救世界：凯、杰、科尔、赞恩、劳埃德和尼娅。

故事描述，原本过著正常生活的主角樱羽一时，某日发现自己居然是伊贺忍者第19代的正统继承人。以此为契机，他将被卷入伊贺与甲贺忍者间长期对立的世界，并且迎接那残酷的命运到来。

　　2044年的纽约，大反派朗格勾结外星恶势力试图毁灭地球，大量外星人通过神秘传送门入侵，将城市化为灰烬。忍者神龟们虽负隅顽抗仍不敌敌人攻势，死伤惨重。怀抱着忍者最强武器——希望，忍者神龟们决定回到过去时空，找到开启传送门的…

　　身怀绝技、武功高强的凯西·伯曼（斯科特·阿金 Scott Adkins 饰）即将和他最爱的女子奈美子（肘井美佳 饰）步入婚姻殿堂，并迎来属于他们的爱情结晶。某晚，凯西外出购物，而独自在家的奈美子却被入侵者残忍杀害。压抑不住心底的愤…

　　A possessed Ninja doll teams up with a teenage boy to avenge the murder of a poor child factory worker.

　　孙文虎（黄正利饰）是一名具有日本血统的忍者杀手，闯入中原进行教会的计划——除去一切判教人士；武林高手狂龙(巨龙饰）无端被卷入一场无辜的杀戮，当他的爱人被残害，他决定不惜牺牲自己的生命来拯救他的同胞...